L'histoire du blason de la Franche-Comté, anciennement connue sous le nom de Comté de Bourgogne, est marquée par des changements significatifs au fil des siècles. 

 

Initialement, sous l'influence de l'empereur Frédéric Barberousse par son mariage avec Béatrice de Bourgogne, le blason arborait un aigle blanc sur fond rouge, représentatif des armes germaniques. Cependant, en 1280, dans un geste symbolique de rapprochement avec la France, Otton IV, Comte de Bourgogne, adopta un nouveau blason, cette fois-ci orné d'un lion d'or sur fond azur (le blason actuel), marquant une rupture avec l'emblématique aigle germanique figurant toujours sur le blason de Besançon.

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L'annexion de la Franche-Comté à la France après la guerre de 10 ans entraîna la substitution du lion franc-comtois par les fleurs de lys, symboles de la monarchie française. Le siège de Dole et l'écho de la résistance locale, immortalisés par la devise « Comtois rends-toi ! Nenni, ma foi ! », témoignent de l'esprit indomptable de la région.

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Le XXe siècle vit une résurgence du lion franc-comtois, encouragée par des initiatives locales et l'appui de figures économiques telles que Peugeot, contribuant à réaffirmer l'identité et le patrimoine de la Franche-Comté.